- Despacho del C. Secretario de Educación Pública del Estado
- Dirección de Administración y Finanzas
- Dirección de Relaciones Laborales
- Dirección de Planeación Educativa
-
Dirección de Evaluación Educativa
- Departamento de registro y certificación escolar
- Departamento de incorporación revalidación y equivalencia
- Departamento de medición del logro educativo
- Departamento de servicio profesional docente
- Programa para el desarrollo profesional docente
- Coordinación CURP
- Coordinación de acreditación a niños migrantes e inmigrantes
- Coordinación del archivo general de control escolar
- Coordinación estatal de los concursos de oposición de educación básica
- Dirección de Educación Terminal
- Dirección de Profesiones y Educación Media Superior y Superior
-
Dirección de Educación Básica USET
- Departamento de educación preescolar USET
- Departamento de educación indígena USET
- Departamento de educación extraescolar
- Departamento de secundarias generales
- Departamento de escuelas secundarias técnicas
- Departamento de telesecundarias USET
- Coordinación de educación inicial
- Coordinación general de programas federales
- Coordinación estatal de tecnología educativa
- Dirección de Educación Primaria
- Dirección de Educación Física USET
- Departamento Administrativo SEPE
- Dirección de Educación Básica SEPE
- Dirección de Cultura Recreación y Deporte